Esta nota contiene spoilers de Kingdom Hearts RE: Coded, por lo que si desean conocer la historia jugando al título, les recomendamos que no continúen con la lectura. Además, para entender algunos conceptos, pueden ver nuestra Guía para entender Kingdom Hearts.
En uno de sus Diarios, Pepito Grillo encuentra un mensaje extraño que decía “Their hurting will be mended when you return to end it” (Su sufrimiento será resuelto cuando vuelvas para terminarlo). Con la ayuda del Rey Mickey, crean una base de datos a partir del diario para intentar resolver este mensaje y saber quién lo escribió, recreando los mundos que visitaron Sora, Donald y Goofy durante los eventos de Kingdom Hearts. Estos mundos estaban llenos de “Bugs” datos corruptos que impedían descifrar el mensaje, por lo que el Rey Mickey pide ayuda al Sora del Diario, llamado Sora Digital.
Al iniciar la aventura, Sora Digital se encuentra con una figura encapuchada con ropa similar a la que usaban los miembros de la Organización XIII, quien le indica que para arreglar todos los mundos y poder entender el mensaje debía arreglar las Cerraduras (Keyholes) de cada uno de ellos. Durante el camino, Data Sora descubre que la figura encapuchada que lo estuvo ayudando era Data Riku, una versión digital que el diario había tomado del amigo real de Sora para ayudarlo en su viaje. Además, el Rey Mickey, Donald y Goofy no se encontraban en el mundo real, sino que estaban metidos dentro del mundo de datos. Esto es debido a que Maléfica (la real) y Pete intentaban soltar la oscuridad que se encontraba dentro del mundo digital al mundo real. Al enfrentarse a ella, la Llave Espada de Data Sora es destruída y Data Riku es raptado.
Gracias a la ayuda de la amistad de Goofy, Donald y Sora (o Data Sora), este último puede recrear su Llave Espada, y así intentar salvar a Data Riku, quien fue infectado con Bugs por Pete. Data Sora logra vencer a Data Riku, solamente para luego tener que luchar contra su propio Sincorazón, quien era la razón por la cual todo el Diario se había llenado de Bugs.
Data Sora había limpiado el Diario digital de todos sus Bugs, pero el mensaje aún era un misterio. El Rey Mickey recibe un mensaje de Data Riku donde le informa que hay nuevos datos encontrados: un mundo especial creado para que Data Sora aprenda a aceptar el dolor. Al lograrlo, Data Naminé aparece y le explica que el mensaje era de ella, debido a que descubrió que los recuerdos de Sora están conectados con Roxxas, Axel, Xion, Aqua, Terra y Ventus, todas personas que sufrían.
El Rey Mickey se compromete a aliviar su dolor, y es por ello que solicita ayuda nuevamente a Sora, enviándole la carta que vemos al final de Kingdom Hearts II. En un final secreto que fue lanzado con Kingdom Hearts Re: Coded para Nintendo DS, vemos que Yen Sid le informa al Rey Mickey que, al destruí a Ansem y Xemnas, Xehanort volverá a la vida, ya que si el Sincorazón y el Incorpóreo de una persona son eliminados esta revive. Es por ello que Yen Sid deberá preparar a Sora y Riku para que realicen el examen de Maestros de Llave Espada, cuya historia podremos ver en Kingdom Hearts: Dream Drop Distance.
